Seria wydawnicza została zainicjowana i zaprojektowana w 1994 roku przez profesora Jerzego Michalewicza, dyrektora Archiwum UJ, z myślą o publikacji inwentarzy i wyników badań naukowych, których podstawę źródłową stanowiły akta przechowywane w Archiwum UJ. Publikację prac zaplanowano w sześciu seriach:

   Seria A. Inwentarze
   Seria B. Corpus academicorum Universitatis Iagellonicae saec. XV-XX
   Seria C. Corpus studiosorum Universitatis Iagellonicae in saec. XV-XX
   Seria D. Liber beneficiorum et benefactorum Universitatis Iagellonicae in saec. XV-XVIII
   Seria E. Kraków - dzielnica uniwersytecka. Studium architektoniczno-urbanistyczne XIV-XX w.
   Seria F.  Varia